Tim dengan peringkat pertama dan kedua dari masing-masing grup pada akhir fase grup akan lolos ke semi-final. Semifinal dan final akan dimainkan dalam format kandang dan tandang.
Mengenai detail Shopee Cup™ musim 2024/25 seperti format kompetisi, klub-klub yang akan ikut serta akan ditentukan dalam pengundian resmi atau official draw pada minggu pertama bulan Mei 2024. Soal tempat dan tanggal pengundian akan diumumkan lebih lanjut.***